Las directrices de actuación para aplicar las prioridades que financia el Fondo Europeo de la Pesca (FEP) se recogen en el Programa operativo. Hay un único programa FEP por Estado miembro, lo que permite concentrar las actuaciones y maximizar su eficacia. Además, junto con el Programa operativo, el Plan Estratégico Nacional ayuda a determinar las prioridades, los objetivos y los recursos públicos necesarios para su consecución. Este documento abarca todos los ámbitos de la PPC y, por ello, tiene un alcance más amplio que el de los programas del FEP.
Por tanto y cumpliendo con las directrices de dicho Reglamento, la Secretaría General de Pesca, ha realizado los denominados "Documentos de programación", por los cuales los Estados miembros deberán diseñar sus estrategias en relación al sector pesquero, teniendo en cuenta la Política Pesquera Común, así como la programación de las líneas financieras, el reparto de fondos, por las que va a implementar el Fondo Europeo de la Pesca.
