El Parque Nacional de Gorgona abarca las aguas que circundan las islas de Gorgona y Gorgonilla a unos 56 kilómetros de la costa continental colombiana.
Además de su ubicación geográfica estratégica, las aguas de Gorgona cuentan con un accidente muy particular: profundidades de hasta 85 metros que la separan de la zona costera continental. Su extensión es de 61.687 ha incluyendo las islas y el área marina circundante.